ان المسار السريري للكوفيد 19، والاستجابة المناعية للمضيف توفر أساسا لاستراتيجيات اختبار التشخيص.

الكوفيد في الغالب مسبب لأمراض الطرق التنفسية، وينتقل إلى حد كبير من خلال استنشاق قطيرات صغيرة, هنالك متغيرات فيروسية جينية جديدة، بما في ذلك البديل B.1.617.2 (DELTA) (DELTA)، لها قابلية للانتقال أعلى من فيروس D614G الأصلي، مما يؤدي إلى انتشار أسرع للمرض بين السكان، لكنهم يتشاركون في نفس الفيزيولوجيا المرضية للعدوى والمرض.

 قامت منظمة الصحة العالمية  باطلاق اسم B.1.1.529() (OMICRON) معتبرة اياه "المتغير المثير للقلق" السادس والأدلة المتاحة تشير إلى أنه أكثر اعدوى ولكنه أقل فوعة من المتغيرات السابقة.

تظهر أعراض Covid-19 بعد فترة 2 إلى 14 يوما بعد التعرض، مع بداية متوسط 5 إلى 6 أيام بعد الإصابة.

معظم الأشخاص الذين يتعرضون للاصابة بفيروس كوفيد لديهم أعراض خفيفة إلى معتدلة ، ولكن البعض، لا سيما الأكبر سنا أو غير ملقحين وأولئك الذين لديهم ظروف طبية أو مثبطي المناعة، قد يكون لديهم مرض خطير .

 قد تحدث  العدوى أيضا دون التسبب في الأعراض ، ويمكن للأشخاص بدون أعراض المساهمة في انتقال الفيروس من شخص الى اخر.

ان المناعة التي يكونها الشخص بعد التطعيم الأولي تكون مناعة شاملة ، ولكن تم طرح التطعيمات الداعمة للحد من حدوث النتائج السلبية للمرض.

 قد تكون مستويات الحمل الفيروسية والطرح الفيروسي مشابهة بين البالغين الملقحين وغير الملقحين، لكن البالغين الذين لم يتلقوا تمنيع معزز لديهم خطر أعلى للاستشفاء والموت عامة من أولئك الذين تلقوا جرعة واحدة ,

هناك ثلاثة مؤشرات مشتركة لاجراء اختبار SARS-CoV-2 ، على النحو الموصى به من قبل منظمة الصحة العالمية  ومراكز السيطرة على الأمراض والوقاية منها CDC

  أولاً ، يجب على أي شخص يعاني من أعراض Covid-19 ، بغض النظر عن حالة التطعيم  الخضوع لاختبار SARSCoV-2.

ثانيًا ، يجب أن يخضع الأشخاص الذين لا تظهر عليهم أعراض ، بغض النظر عن حالة التطعيم ، والذين هم على اتصال وثيق بشخص مصاب بعدوى SARS-CoV-2 المعروفة أو المحتملة لاختبار تشخيصي.

الأشخاص الذين لم يتم تلقيحهم أو الذين لم يتلقوا اللقاح المعزز خلال الأشهر الستة السابقة لديهم احتمالية أعلى للإصابة بالعدوى قبل الاختبار المسبق من أولئك الذين تم تطعيمهم بالكامل ، في حين أن الآخرين لديهم احتمالية منخفضة أو متوسطة للإصابة بالعدوى.

ثالثًا  يجب النظر في الاختبار عند الأشخاص الذين لا يعانون من أعراض والذين كانوا في مكان يكون فيه خطر انتقال العدوى مرتفعًا ، كما هو الحال في الطائرة أو في حدث رياضي.  يمكن أيضًا النظر في استخدام RDT في الأشخاص الذين سيتواجدون في بيئة جماعية ، على الرغم من أنه قد يكون لديهم احتمالية منخفضة للإصابة بالعدوى ؛ ولكن يجب أن يتم هذا الاختبار في أقرب وقت ممكن من التجمع.

يمكن إجراء الاختبار التشخيصي لعدوى SARS-CoV-2 الحادة إما باستخدام NAATs الجزيئي أو المقايسات القائمة على المستضد ، وكلاهما متاح في صورة RDTs.  NAATs الجزيئية تكتشف وجود أهداف جينية فيروسية ، بما في ذلك جينات N و S و E).  تعد فحوصات (RT-PCR) أكثر الاختبارات التشخيصية المستخدمة على نطاق واسع لـ SARS-CoV-2 NAATs في جميع أنحاء العالم.  الاختبارات المستندة إلى المستضد ، والتي

تسمى أيضًا المقايسات المناعية ، تكتشف مجالات البروتينات السطحية ، بما في ذلك المجالات النووية ، والارتفاع ، والمستقبلات الخاصة بـ SARS-CoV-2.

 على الرغم من أن كلتا الطريقتين نوعية للغاية ، إلا أن NAATs عمومًا أكثر حساسية من الاختبارات القائمة على المستضد لأنها تضخم التسلسلات الجينومية المستهدفة.

لا ينبغي استخدام اختبارات الكشف عن الأجسام المضادة IgG أو IgM لـ SARS-CoV-2 لتشخيص العدوى الحادة.

 يمتد الأداء السريري لاختبار SARSCoV-2 التشخيصي إلى ما وراء أهداف العوامل الممرضة مثل البروتينات الفيروسية والحمض النووي الريبي ويتضمن الخصائص السريرية (على سبيل المثال ، الحمل الفيروسي للمريض والوقت منذ التعرض أو الأعراض)

أجرت إدارة الغذاء والدواء (FDA) ومنظمة الصحة العالمية عملية مراجعة سريعة لتسريع الموافقة المؤقتة على اختبارات تشخيص SARS-CoV-2.  اعتبارًا من ديسمبر 2021 ، منحت إدارة الغذاء والدواء (FDA) تصريح استخدام الطوارئ (EUA) لـ 28 RDTs لتشخيص عدوى SARS-CoV-2 الحادة ، ومن المتوقع إجراء المزيد من الاختبارات المصرح بها من قِبل إدارة الأغذية والعقاقير FDA.   في الاتحاد الأوروبي ، أكثر من 140 شركة مختلفة لديها اختبار RDT قائم على مستضد مسجل في "القائمة المشتركة" للاستخدام المعتمد.  33- RDTs الجزيئية والقائمة على المستضد مع حالة EUA لها أهداف مختلفة من العوامل الممرضة ، وطرق الكشف ، ومواقع المسح للحصول على عينات ، ومؤشرات للاستخدام ، وخصائص الأداء).

 من أجل الحصول على موافقة مؤقتة ل RDT من قبل إدارة الأغذية والعقاقير ومنظمة الصحة العالمية والهيئات التنظيمية للاتحاد الأوروبي ، يجب أن يكون لديها حساسية 80٪ على الأقل (توافق النسبة المئوية الإيجابية) ونوعية98٪ (توافق النسبة المئوية السلبية) ، مقارنةً بالمعيار المرجعي  من اختبار RT-PCR المختبري ، على الرغم من أن منظمة الصحة العالمية سمحت بنوعية تبلغ 97 ٪ أو أكثر. 

 تعتمد موافقة إدارة الغذاء والدواء أيضًا على دراسة تشمل ما لا يقل عن 30 شخصًا مصابًا بعدوى SARS-CoV-2 و 30 شخصًا غير مصاب بعدوى SARS-CoV-2.   

يستند EUA من الاتحاد الأوروبي إلى بيانات الأداء التي يمكن الحصول عليها إما من خلال دراسة إكلينيكية مستقبلية أو من خلال الاختبارات المعملية بأثر رجعي.

 تطلب الهيئات التنظيمية مراقبة أداء الاختبار والإبلاغ عنه فيما يتعلق بالمتغيرات الفيروسية ، على الرغم من أن هذه المتطلبات لم يتم تنفيذها بشكل جيد ؛

 لا تتطلب تحققًا مستقلاً من بيانات التحقق السريرية المقدمة من كل مصنع اختبار.

 بالنسبة للعديد من الاختبارات التشخيصية قصيرة المدى (RDTs) الجزيئية المخصصة للاستخدام في الأماكن منخفضة التعقيد ، أصدرت إدارة الغذاء والدواء حالة EUA مع شهادة تنازل عن تعديلات المختبرات السريرية (CLIA) (والتي يمكن الحصول عليها من قبل مراكز الصحة المجتمعية ودور رعاية المسنين والمدارس ،  وأماكن التجمع الأخرى لجمع العينات وإجراء الاختبارات).  تمت الموافقة أيضًا على بعض اختبارات التشخيص السريع هذه للاستخدام المنزلي.

هذه الاختبارات الجزيئية RDTs ، التي تستخدم RT-PCR ، أو تضخيم متساوي الحرارة بوساطة حلقة ، أو تضخيم الإنزيم المقاس للكشف عن الحمض النووي الريبي الفيروسي لـ SARS-CoV-2 ، تقدم نتائج في 13 إلى 55 دقيقة. تمت الموافقة على جميع RDTs الجزيئية للاستخدام في الأشخاص الذين تظهر عليهم الأعراض ، كما وافق عدد قليل على فحص الأشخاص الذين لا تظهر عليهم أعراض.

 وبالمثل ، تلقى العديد من الاختبارات التشخيصية السريعة المستندة إلى مستضد حالة EUA من إدارة الغذاء والدواء الأمريكية (FDA) لاستخدامها في الإعدادات التي تلقت تنازلًا عن CLIA أو للاستخدام المنزلي.  هذه الاختبارات RDT المستندة إلى المستضد هي مقايسات مناعية تستخدم أجسامًا مضادة خاصة بـ SARS-CoV-2 لربط البروتينات الفيروسية (غالبًا nucleocapsid) وتوليد إشارة بصرية أو إشارة ومضان.

 معظمها عبارة عن فحوصات التدفق الجانبي على غشاء النيتروسليلوز ، في حين أن البعض الآخر ينطوي على استخدام شرائط اختبار موائع جزيئية رفيعة ، ، أو قراءات تألق مناعي لتعزيز التقاط البروتين واكتشافه.

تمت الموافقة على جميع اختبارات التشخيص السريع القائمة على المستضد للاستخدام في الأشخاص الذين تظهر عليهم الأعراض وتقدم نتائج في غضون 10 إلى 30 دقيقة.

 يتمتع العديد منهم بوضع EUA لفحص الأشخاص الذين لا تظهر عليهم أعراض ؛  تهدف معظم هذه الاختبارات إلى استخدامها مرتين على مدى 3 أيام ، على الرغم من الموافقة على استخدام عدد صغير مع حساسية عالية للكشف عن العدوى بدون أعراض. 

 على الرغم من أن دراسات المقارنة المباشرة محدودة وغالبًا ما تكون بأثر رجعي ، إلا أن اختبارات التشخيص السريع القائمة على المستضد لها حساسية أقل من اختبارات RDT الجزيئية ، مقارنةً بالمعيار المرجعي لاختبارات RT-PCR المعتمدة على المختبر ، خاصةً بين الأشخاص الذين لديهم حمولة فيروسية منخفضة أو ليس لديهم تضاعف  الفيروس.  ومع ذلك ، يمكن للاختبارات التشخيصية السريعة المستندة إلى مستضد الكشف عن العدوى في وقت مبكر من مسار المرض (في غضون 5 إلى 7 أيام بعد ظهور الأعراض) عندما تكون الأحمال الفيروسية عالية (أي عتبة دورة RT-PCR منخفضة) ؛  هذه الأحمال الفيروسية العالية مسؤولة عن معظم عمليات النقل.  أظهرت الدراسات- درجات متفاوتة من الدقة السريرية (الحساسية ، 36 إلى 82٪ ؛ النوعية ، حوالي 98 إلى 100٪) عند استخدام اختبارات التشخيص السريع القائمة على المستضد لفحص الأشخاص الذين لا تظهر عليهم أعراض

 على الرغم من أن الاختبارات التشخيصية السريعة (RDTs) توسع نطاق استخدام الاختبارات ، فقد ثبت أنها أكثر دقة عند إجرائها بواسطة مقدمي رعاية صحية مدربين أكثر من الأشخاص غير المدربين.